解密档案之眼中钉故事发生在1947年。故事主人公秦风（丁海峰饰）和白雪（徐筠饰）本是一对恋人，秦风在共产党组织反对蒋家王朝的学生运动中表现出色，被他的老师――中共地下党的领导人陈天浩（高明饰）吸收入党，并派往敌人的心脏从事党的地下工作，最终成为一名出色的特工。由于陷蔽工作的特殊性，秦风只能不辞而别。刚怀孕的白雪此时家破人亡，无处安身，只好接受她的姑姑（王亚君饰）一一国民党军统王牌特工的安排，参加了国民党军统的特训班。生下儿子后，又派往国外训练，后以进步青年的身份潜入我解放区，成为解放军的一名干部，代号“银狐”。                                                                    在一场关系中国解放进程的战役前夕，国民党军统特务头子派遣白雪来到滨江，目的是摸清我军主攻方向，刺探我军情报，此时，秦风也调回解放区，肩负着破获以“银狐”为首的敌特组织重任。                                                                    一对恋人在分别六年后，终于相见。秦风怀着深深的内疚，依旧想唤起白雪的爱情。面对白雪的冷漠和怨恨，他以炽热的爱和坚定的信仰思想慢慢熔化和改变着白雪。白雪的信仰在摇摆、在改变。特务头子――白雪的婶婶察觉后，利用白雪的儿子要胁，迫使白雪继续与人民为敌。终于，在痛苦和无奈间挣扎的秦风向曾经心爱的人举起了枪……                                                                    一对生死恋人，两个高级特工，情仇交织，斗智斗勇。不同的信仰决定了两个人不同的命运。这是一部中国版的《史密斯夫妇》。